14年前,初(chū )号机(jī )疑似神化第一(yī )形态的觉醒带来近三冲击,使世界发生前所未有的(de )巨变。在此之后(hòu ),葛城美里(lǐ )(三(sān )石琴乃 配音)等NERV旧部出走,成(chéng )立了反抗seele和NERV的Wille。Wille授命明日香(宫村优(yōu )子 配音)和真(zhēn )里(坂本(běn )真绫(líng ) 配音)夺(duó )回被(bèi )封印在卫星轨(guǐ )道上的初号机和碇真嗣(绪方惠美(měi ) 配音),但绝对(duì )禁止真嗣登上(shàng )初号机。感(gǎn )受到(dào )周遭的敌意,懵(měng )懂的真嗣跟随绫波丽(林原惠美 配音)登上突然(rán )入侵的九号机(jī ),返回了千(qiān )疮百(bǎi )孔的NERV总部。在这(zhè )里,他意外重逢(féng )朝思夜想的绫波,还从父亲那里得知(zhī )自己将和美少(shǎo )年渚薰(石田(tián )彰